Гены и геномы

Сингер М., Берг П.0-935702-17-2

Университетское руководство по молекулярной биологии, написанное выдающимися американскими учеными, членами Национальной академии наук (П.Берг – лауреат Нобелевской премии). Книгу отличают общебиологический подход, глубина теоретических обобщений, изящнаяи наглядная форма подачи материала. Во 2-м томе рассматриваются следующие вопросы: структура и экспрессия генов эукариот, молекулярная структура геномов эукариот, геномные перестройки с участием разнообразных мобильных элементов, происходящие запрограммированным и случайным образом. Для молекулярных биологов, преподавателей и студентов университетов, специалистов.

---

Table of contents :
Обложка……Page 1
Титульный лист……Page 4
От редактора перевода……Page 6
Предисловие……Page 7
Благодарности……Page 11
Введение……Page 12
Клеточный цикл……Page 17
Строение хромосом……Page 19
Наследование одиночных признаков……Page 24
Рекомбинация……Page 26
Связь между генами и белками……Page 27
Гены и ДНК……Page 28
Генетика – молекулярная наука……Page 31
Перенос генетической информации в клетке……Page 32
Структура и сохранение геномной ДНК……Page 33
Экспрессия и регуляция генов……Page 34
Глава 1. Молекулы генетического аппарата……Page 39
а. Компоненты молекулы ДНК и соединяющие их химические связи……Page 40
б. Спиральная структура ДНК……Page 42
в. Альтернативные формы двойной спирали ДНК……Page 43
д. Разнообразие форм ДНК……Page 45
е. Денатурация и ренатурация ДНК……Page 48
ж. Упаковка ДНК в хромосомах……Page 50
в. Структура РНК……Page 53
д. Гибридные спирали ДНК-РНК……Page 55
а. Компоненты белков и соединяющие их химические связи……Page 57
б. Размер и форма белков……Page 59
в. Чем определяется конформация белка……Page 60
а. Матричная функция ДНК при репликации……Page 68
б. Репликация начинается в определенных точках……Page 69
в. Репликация ДНК полуконсервативна……Page 73
г. Комплементарное копирование оснований, перенос дезоксинуклеотидов и лигирование ДНК при репликации……Page 75
д. Ключевые ферменты, участвующие в синтезе ДНК……Page 79
е. Для репликации необходимо раскручивание спирали……Page 83
ж. Инициация образования новых цепей ДНК и их рост в репликативных вилках……Page 87
з. Терминация репликации ДНК и расхождение дочерних спиралей……Page 93
а. Репликация геномов ретровирусов……Page 94
2.3. Репарация ДНК……Page 98
а. Репарация путем прямого восстановления исходной структуры……Page 100
б. Репарация путем замены модифицированных остатков……Page 101
в. Значение репарации ДНК……Page 103
2.4. Рекомбинация ДНК……Page 104
а. Типы рекомбинации……Page 105
б. Общая рекомбинация между гомологичными молекулами ДНК……Page 106
в. Ферменты, участвующие в общей рекомбинации……Page 109
г. Сайт-специфическая рекомбинация……Page 111
2.5. Репликация……Page 112
а. Транскрипция ДНК в РНК……Page 116
г. Правильная инициация трансляции……Page 117
3.2. Транскрипция: передача информации о нуклеотидной последовательности ДНК на уровень РНК……Page 118
а. Синтез РНК на ДНК-матрице……Page 119
б. ДНК-зависимые РНК-полимеразы……Page 122
в. Транскрипция инициируется в особых нуклеотидных последовательностях……Page 124
г. Терминация транскрипции и отделение цепей РНК……Page 126
а. Группы генов, кодирующих рРНК и тРНК……Page 128
в. Образование зрелых тРНК из более крупных транскриптов……Page 129
3.4. Генетический код……Page 131
а. Аминокислотная последовательность белков соответствует нуклеотидной последовательности кодирующих их генов……Page 132
в. Расшифровка генетического кода……Page 133
г. Избыточность генетического кода……Page 137
д. Универсальность генетического кода……Page 138
а. Присоединение аминокислот к “родственным” тРНК……Page 139
б. На рибосомах осуществляются спаривание аминоацил-тРНК с кодонами и сборка белковых цепей……Page 143
3.6. Трансляция мРНК у прокариот……Page 146
а. Условия инициации……Page 147
б. Элонгация полипептидной цепи……Page 151
3.7. Некоторые общие особенности процесса трансляции……Page 152
б. Трансляция бактериальных мРНК может осуществляться параллельно транскрипции……Page 153
г. Взаимодействие кодона и антикодона……Page 154
3.8. Трансляция мРНК у эукариот……Page 158
а. Особые модификации мРНК эукариот……Page 160
а. Ингибирование РНК-полимеразы……Page 161
б. Ингибирование трансляции……Page 162
а. Посттрансляционная модификация полипептидных цепей……Page 164
б. Доставка эукариотических белков к клеточным мембранам и проникновение через них……Page 165
в. Транспорт белков в эукариотические клеточные органеллы……Page 171
а. Регуляция содержания РНК в процессе биосинтеза……Page 173
б. Согласованная регуляция экспрессии прокариотических генов……Page 174
в. Регуляция экспрессии лактозного оперона……Page 175
г. Регуляция экспрессии триптофанового оперона……Page 179
д. Временная регуляция генной экспрессии в жизненном цикле бактериофага лямбда……Page 182
е. Трансляционная регуляция экспрессии некоторых генных продуктов……Page 186
Общие работы для всех глав части I……Page 190
2.1…….Page 191
3.2…….Page 192
3.6…….Page 193
3.11…….Page 194
Введение……Page 196
Трансформация бактерий……Page 197
Конъюгация……Page 198
Трансдукция……Page 199
Принципы клонирования……Page 203
Концепция рекомбинантной ДНК……Page 204
Бактериальные плазмиды……Page 205
Рестриктирующие эндонуклеазы……Page 208
а. Общие свойства……Page 212
б. Нуклеазы, специфичные в отношении одноцепочечной ДНК……Page 213
в. Нуклеаза Bal 31……Page 214
а. Три типа эндонуклеаз рестрикции……Page 215
б. Типичная рестриктирующая эндонуклеаза типа II……Page 216
в. Различные группы рестриктирующих эндонуклеаз типа II……Page 217
д. Защита ДНК посредством метилирования……Page 219
4.4. Полинуклеотидкиназа……Page 222
б. Ник-трансляция……Page 223
4.7. РНК-зависимые ДНК-полимеразы (обратные транскриптазы)……Page 224
б. Синтез липких концов……Page 225
4.9. Poly(A)-полимераза……Page 227
Глава 5. Инструментарий: системы хозяин-вектор……Page 228
б. “Гостеприимство” хозяина……Page 229
г. Некоторые примеры……Page 230
а. Модульная структура плазмид……Page 231
б. Конструирование векторов для отбора……Page 233
в. Плазмидный вектор pBR322……Page 235
г. Другие векторы, используемые для разных целей……Page 237
а. Некоторые различия между плазмидными и фаговыми векторами……Page 238
б. Фаг лямбда……Page 239
в. Векторы, сконструированные на основе фага лямбда……Page 241
г. Упаковка лямбда-векторных молекул в фаговые частицы……Page 242
д. Фаг М13……Page 243
е. Векторы, сконструированные на основе фага М13……Page 244
а. Космиды……Page 247
б. Фазмиды……Page 248
б. Грамположительные организмы……Page 250
в. Челночные векторы……Page 251
б. Векторы, способные реплицироваться в клетках дрожжей……Page 253
в. Стабильная трансформация при рекомбинации с дрожжевым геномом……Page 255
а. Трансформация клеток животных……Page 257
б. Векторы на основе SV40……Page 261
в. Векторы на основе вируса папилломы крупного рогатого скота……Page 266
г. Векторы на основе ретровирусов……Page 268
б. Плазмида pTi-A, индуцирующая образование опухолей……Page 274
в. Конструирование векторов рекомбинантных ДНК с использованием pTi……Page 276
б. Вставки геномной ДНК……Page 278
в. Синтетические вставки……Page 281
г. Копирование РНК с образованием ДНК……Page 286
а. Соединение концов……Page 287
б. Присоединеие липких концов……Page 290
а. Перенос рекомбинантных молекул из пробирки в клетку……Page 291
б. Отжиг с комплементарным полинуклеотидом……Page 293
в. Определение экспрессии гена в клетках……Page 300
6.5. Библиотеки……Page 303
б. Библиотеки кДНК……Page 305
6.6. Некоторые стратегии клонирования генов и кДНК……Page 317
а. Размер вставки……Page 318
г. Определение положения интересующего нас сегмента во вставке……Page 319
7.2. Тонкая структура клонированной вставки: нуклеотидная последовательность……Page 320
а. Общие принципы……Page 321
б. Химическое секвенирование……Page 322
в. Ферментативное секвенирование……Page 325
а. Хранение информации о первичной структуре……Page 329
б. Структурный анализ……Page 331
в. Биологическое значение……Page 332
а. Молекулярная локализация……Page 334
б. Хромосомная локализация……Page 335
в. Нестабильность при клонировании……Page 339
б. Оценка числа копий по кинетике реассоциации ДНК……Page 340
в. Оценка числа копий с помощью гибридизации в условиях насыщения……Page 343
б. Делеционные мутанты……Page 344
г. Точечные мутации……Page 345
7.7. Изучение функций клонированных сегментов ДНК……Page 349
а. Характеристика внутриклеточных транскриптов, соответствующих клонированным сегментам ДНК……Page 350
б. Функциональное тестирование клонированной ДНК……Page 354
а. Выбор системы экспрессии……Page 355
б. Экспрессирующие векторы, используемые в E.coli……Page 357
в. Экспрессирующие векторы, используемые в клетках дрожжей……Page 360
7.9. Ферментативная амплификация сегментов ДНК и РНК……Page 361
Введение……Page 365
5.1…….Page 366
5.7…….Page 367
7.1…….Page 368
7.6…….Page 369
7.9…….Page 370
Оглавление……Page 371